Scientific journal

Modern problems of science and education

ISSN 2070-7428

"Перечень" ВАК

ИФ РИНЦ = 1,006

Цель исследования. Изучить особенности  структурно-функциональной организации хромосом в интерфазных ядрах клеток головного мозга на примере феномена соматического спаривания хромосом в норме и при атаксии телеангиэктазии (АТ) - генетически обусловленном моногенном заболевании, для которого характерна хромосомная нестабильность и прогрессирующая мозжечковая дегенерация.

Материалы и методы. В данной работе проведен молекулярно-цитогенетический анализ соматического спаривания гетерохроматиновых районов хромосом 1, 7, 8, 9, 11, 16, 17, 18 с применением различных вариантов метода интерфазной и количественной флюоресцентной гибридизации ДНК in situ или FISH [1,4,5,10]. Молекулярно-цитогенетические исследования проводились с использованием постмортальных тканей коры больших полушарий и мозжечка больных АТ и индивидуумов из контрольной группы, согласно ранее описанному протоколу [6]. Аутопсийные образцы тканей мозга (7 образцов пациентов с АТ и 7 контрольных образцов) были любезно предоставлены Банком тканей Мэрилэндского университета, США (Brain and Tissue Bank for Developmental disorders (NICHHD), University of Maryland,USA).Исследованы интерфазные ядра постмортальных клеток головного мозга (35000 клеток образцов мозжечка больных АТ и 35000 клеток из образцов мозжечка в контроле). Статистический анализ проводили по t-критерию Стьюдента для независимых выборок.

Результаты исследования и их обсуждение. В данной работе впервые было проведено сравнительное  исследование особенностей спаривания гетерохроматиновых участков генома человека в норме и при АТ. Мы использовали оригинальные  методы MFISH/QFISH и ICS-MCB [1,7] с использованием ДНК проб на хромосомы 1, 9, 16, 18, 19 и Х, специально разработанные для анализа постмитотических клеток мозга человека. Результаты анализа организации хромосом в интерфазных клетках головного мозга показали, что хромосомы занимают определенную территорию внутри ядра, которая тем не менее не является строго заданной. Иными словами, в отличие от неоднократно исследованных митотически активных клеток других тканей [3,7,8,9], расположение хромосом в интерфазных ядрах нервных клеток значительно варьировало [1,2,4]. Наиболее частыми областями, в которых локализовались хромосомы, являлась периферия и границы ядрышка, которые определялись, как область ядра, не окрашиваемая DAPI (краситель, взаимодействующий только с молекулами ДНК). Результаты молекулярно-цитогенетического анализа соматического спаривания гетерохроматиновых районов хромосом в клетках коры и мозжечка у больных АТ и в контроле представлены в таблицах 2 и 3. При исследовании соматического спаривания методом интерфазной и количественной FISH с прицентромерными ДНК зондами на хромосомы 1, 7, 8, 9, 11, 16, 17, 18 нами были определены частоты встречаемости соматического спаривания по каждой исследуемой хромосоме. При использовании метода интерфазной FISH соматическое спаривание в интерфазном ядре визуализируется благодаря свечению специфического зонда на хромосоме. Соматическое спаривание в интерфазных ядрах и истинная моносомия различаются более интенсивным и крупным сигналом в сравнении с сигналом при истинной моносомии [1,4]. Результаты анализа соматического спаривания представлены в таблицах 2-3. Хромосомы, различия частот спаривания которых были статистически значимы (p<0,05), выделены подчеркиванием.

Табл. 2. Результаты молекулярно-цитогенетического анализа соматического спаривания в клетках мозжечка у больных АТ и у здоровых индивидуумов (в процентах)

Частота соматического спаривания гетерохроматина некоторых хромосом была различна в клетках мозжечка в норме и при патологии. Например, при сравнении средних частот ассоциации хромосомы 7 в интерфазных клетках мозжечка в контрольной группе составило 14,5±7,3 (95 % ДИ 7,7-21,2) и у больных АТ - 6,6±3,4 (95 % ДИ 3,5-9,7), т.е. выявлены статистически значимые различия (р=0,02) (табл.2).

Табл. 3. Результаты молекулярно-цитогенетического анализа соматического спаривания в клетках коры головного мозга у больных АТ и у здоровых индивидуумов (в процентах)

Также статистически значимые различия наблюдали по хромосоме 18 (р=0,03) при сравнении средних частот ассоциации хромосом в интерфазных ядрах коры головного мозга в контрольной группе - 14,0±5,7 (95 % ДИ 8,7-19,3) и у больных АТ - 8,1±1,2 (95 % ДИ 5,2-10,9) (табл.3). Сравнительный анализ средних частот соматического спаривания по каждой хромосоме между корой головного мозга и мозжечком (данные приведены в табл.2 и 3) показал статистически значимые различия по хромосоме 11 (р=0,001) как в контроле, так и  в группе больных АТ (р=0,009). В группе больных АТ статистически значимые различия между корой и мозжечком наблюдались также и для хромосомы 9 (р=0,0001).

Для большинства исследуемых хромосом не было выявлено статистически значимых различий по частоте соматического спаривания в коре и мозжечке как в норме, так и при АТ. Следовательно, можно предположить, что гетерохроматиновые участки гомологичных хромосом, обладая способностью к ассоциациям (или спариванию) в интерфазном ядре, подчиняются определенным закономерностям, образуя в целом строго воспроизводимый паттерн ассоциированных хромосомных территорий. Следовательно, гомологичные хромосомы в клетках мозга могут образовывать ассоциированные в области гетерохроматина "общие" для гомологичных хромосом территории или домены интерфазного ядра. Это свидетельствует в пользу относительной стабильности организации интерфазных хромосом в ядрах нервных клеток  и о важном значении участков структурного гетерохроматина в организации внутреннего пространства интерфазного ядра. Тем не менее детальный анализ ассоциаций гетерохроматина выявил достоверные различия между некоторыми гомологичными хромосомами  по частоте спаривания в нервных клетках как в норме, так и при АТ. При сравнении средних частот ассоциации хромосомы 7 в интерфазных клетках мозжечка у контрольной группы - 14,5±7,3 (95% ДЕ 7,7-21,2) и у больных АТ - 6,6±3,4 (95% ДЕ 3,5-9,7) выявлены статистически значимые различия (р=0,02). Также статистически значимые  различия наблюдали по хромосоме 18 (р=0,03) при сравнении средних частот ассоциации хромосом в интерфазных ядрах коры головного мозга  контрольной группы - 14,0±5,7 (95% ДЕ 8,7-19,3) и у больных АТ - 8,1±1,2% (95 % ДЕ 5,2-10,9). Сравнительный анализ средних частот соматического спаривания по каждой хромосоме между корой головного мозга и мозжечком в группе контроля и больных АТ показал статистически значимые  различия по хромосоме 11 (р=0,001) в группе контроля (среднее значение частоты ассоциаций по данной хромосоме для коры головного мозга - 12,3±5,5 % (95 % ДИ 7,3-17,4) и среднее значение частоты ассоциации для мозжечка - 38,5±15,2 % (95 % ДИ 24,5-52,6) в группе больных АТ значение по данной хромосоме соответствовало р=0,009 (среднее значение частоты ассоциаций по данной хромосоме для коры головного мозга-17,1 ± 6,2 (95% ДИ 1,8-32,3) и среднее значение частоты ассоциации для мозжечка - 38,2± 7,5 % (95 % ДИ 31,3-45,2). В группе больных АТ статистически значимые различия наблюдались и для хромосомы 9 (р=0,0001). Среднее значение частоты ассоциации по данной хромосоме для коры головного мозга составило 15,6±2,9 % (95 % ДИ 8,4-22,3), а среднее значение частоты ассоциации для мозжечка было 41,1±10,1 % (95 % ДИ 31,7-50,5). Таким образом, можно заключить, что кора и мозжечок как в норме, так и при АТ имеют тканеспецифичные особенности спаривания гетерохроматина, что отражает эпигенетические различия в организации генома на клеточном уровне в мозге человека.

Предполагается, что соматическое спаривание гомологичных хромосом участками эухроматина, обогащенного кодирующими последовательностями, может быть одним из механизмов эпигенетической регуляции транксрипции генов [3,7,8,10]. Однако роль спаривания участков структурного гетерохроматина, состоящего из повторяющихся и некодирующих последовательностей сателлитных ДНК, до настоящего времени остается неизвестной. Кроме того, феномен соматического  спаривания хромосом в клетках мозга в норме и при патологии до настоящего времени не исследовали. Адекватной моделью для изучения организации интерфазного ядра при патологии мозга являются клетки аутопсийных образцов головного мозга при АТ, так как при данной болезни происходит прогрессирующая нейродегенерация в мозжечке, который, как известно, характеризуется повышенной частотой спаривания гетерохроматиновых районов хромосом. В нашей работе впервые проведен подробный анализ особенностей соматического спаривания структурного гетерохроматина разных хромосом в коре и мозжечке постмортальных образцов мозга в норме и при АТ. Результаты анализа организации хромосом в интерфазных клетках головного мозга показали, что хромосомы занимают определенную территорию, которая, тем не менее, не является строго заданной. Иными словами, в отличие от неоднократно исследованных митотических клеток [3,9], расположение хромосом в интерфазных ядрах клеток головного мозга в значительной степени варьировало. По результатам наших исследований особенностей соматического спаривания для хромосомы 1 в интерфазных ядрах клеток коры и мозжечка в норме и патологии выявлено, что процент спаривания гетерохроматиновых участков разных хромосом, включая хромосому 1, находится в интервале от 30-40 %. Полученные данные отличались от результатов Арнольдуса с соавторами [2], который показал, что частота соматического спаривания гетерохроматиновых участков хромосоме 1 достигала 82 % в мозжечке. Различие по частоте соматического спаривания хромосомы 1 нашего исследования от результатов Арнольдуса и его коллег [2] может быть следствием анализа различных нейронов разных слоев мозжечка, которые представлены различными типами нервных клеток (гранулярные нейроны и клетки Пуркинье). Эти типы клеток характеризуются различной функциональной активностью, которая может приводить к эпигенетическим вариациям в виде различий в частоте спаривания гомологичных хромосом. Для ответа на этот вопрос необходимы дополнительные исследования хромосом в различных типах нейронов как в нормальном мозге, так и при АТ.

Заключение. Таким образом, проведенный молекулярно-цитогенетический анализ особенностей соматического спаривания гетерохроматиновых районов в интерфазных ядрах нервных клеток позволил определить и сравнить частоты соматического спаривания гетерохроматиновых районов разных хромосом человека в клетках коры и мозжечка головного мозга в норме и при АТ - нейродегенеративном заболевании, характеризующимся  мозжечковой дегенерацией. В работе впервые выявлены тканеспецифические различия в частотах ассоциаций хромосом в нервных клетках коры и мозжечка в норме и при АТ, а также особенности спаривания гетерохроматиновых участков хромосомы 7 при АТ, которые могут быть ассоциированы с нейрональной гибелью и нестабильностью определенных хромосомных локусов в клетках мозжечка. Исследования особенностей организации генома и эпигенома в нервных клетках значимы для понимания организации интерфазного ядра, эпигенетических изменений экспрессии генов, происходящих в мозге человека в норме и при  генетически обусловленных патологических процессах.

Рецензенты:

Голимбет Вера Евгеньевна, доктор биологических наук, заведующая лабораторией клинической генетики ФГБУ Научный центр психического здоровья  РАМН, г. Москва.

Востриков Виктор Михайлович, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории клинический нейроморфологии ФГБУ Научный центр психического здоровья  РАМН, г.  Москва.