Scientific journal
Modern problems of science and education
ISSN 2070-7428
"Перечень" ВАК
ИФ РИНЦ = 0,936

EXPRESSION OF MICRORNAS IN MOLECULAR GENETIC BREAST CANCER SUBTYPES

Titov S.E. 2, 3Rodionov V.V. 1, 4Veryaskina Yu.A. 3Gening T.P. 4Abakumova T.V. 4Kometova V.V. 1Torosyan M.Kh. 1Zhimulev I.F. 3Kolesnikov N.N. 3
1 Ulyanovsk Regional Clinical Oncology Center
2 Company"Vector-Best"
3 Institute of Molecular and Cell Biology of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
4 Ulyanovsk state University
In order to determine differences in expression of miRNA in the tumor tissues of various molecular-genetic subtypes of breast cancer and adjacent conditionally normal breast tissue, we assessed the levels of miRNA-21, 221, 222, 155, 205, 20a, 125b and 200a expressionby real time RT-PCR. A significant increase in the levels of expression of the oncogenic miRNA-20a (p = 0.000141) and miRNA-221 (p = 0.037777) in the triple negative cancer in comparison with the luminal A and luminal B / HER2 / neu-negative breast cancer subtypes was established. Assessment of significance of the results was conducted using ROC analysis. For miRNA-221 AUC value was 0.772, for miRNA-20a AUC was 0.949.Therefore, miRNA-20a is an important qualifier for the differentiation of the most aggressive -triple-negative - breast cancer phenotype.
ROC-analysis
miRNA
breast cancer
Рак молочной железы (РМЖ) - злокачественное новообразование, развивающееся из клеток эпителия протоков и долек паренхимы молочной железы. В экономически развитых странах РМЖ - наиболее частая форма онкологического заболевания женщин. Самые высокие стандартизованные показатели заболеваемости РМЖ - 32 % всех случаев впервые диагностированных случаев рака у женщин, - зарегистрированы в США. В России в 2006 году распространенность РМЖ среди пациентов со злокачественными опухолями составила 17,8 %. Исследование венозной крови на опухолевые маркеры не является высокоспецифичным, его не используют для первичной диагностики РМЖ. Определение молекулярных опухолевых маркеров имеет прогностическое значение. В конце 90-х годов прошлого века в группе раков молочной железы были выделены опухоли, в которых не обнаруживаются рецепторы эстрогенов прогестерона и не наблюдается амплификация гена HER-2-nеu, - так называемый тройной негативный РМЖ [8]. На сегодня установлено, что примерно в 80 % случаев трижды негативный и базальный РМЖ совпадают. Но трижды негативный РМЖ включает в себя и некоторые особые гистологические типы.  Окрашивание на базальные кератины при этом считается недостаточно воспроизводимым для широкого использования. На практике клиницисты сталкиваются с ситуациями, когда люминальные подтипы РМЖ, характеризующиеся наиболее благоприятным течением,  ведут себя крайне агрессивно, при этом заболевание быстро прогрессирует и нередко заканчивается летальным исходом. И наоборот, наиболее агрессивный рак с тройным негативным фенотипом может протекать индолентно годами и не требовать адъювантных терапевтических методов лечения. Всё это требует поиска дополнительных молекулярно-генетических маркеров, позволяющих максимально индивидуализировать лечение больных РМЖ. Открытие молекул-ингибиторов синтеза белков на посттранскрипционном уровне -  микроРНК(миРНК) предоставило новые возможности в поиске специфических маркеров новообразований. Показано, что каждый тип опухолей человека обладает уникальным набором экспрессируемых миРНК, и опухоль специфические  миРНК в биологических тканях больного стабильны.  В связи с вышеизложенным, целью настоящего исследования явилось определение различий в экспрессии миРНК в опухолевой ткани инвазивной карциномы молочной железы по сравнению с нормальной тканью, а также анализ вариабельной экспрессии миРНК в молекулярно-генетических подтипах РМЖ. 

Материалы и методы. Материалом для исследования послужили 35 биоптатов опухолевой ткани и 35 биоптатов смежной условно нормальной ткани, соответственно, полученных в ходе оперативного радикального лечения 35 пациенток с диагнозом рак молочной железы в ГУЗ Областной клинический онкологический диспансер г. Ульяновска в 2014 году. Хирургическое лечение проводилось без предварительного химиолучевого воздействия.  Средний возраст пациенток составил 50±5,3 года. Стадия процесса была подтверждена патоморфологически после выполнения оперативного лечения и определялась согласно международной классификации TNM в 7 редакции от 2010 г. В 11 случаях была диагностирована I стадия заболевания, в 17 случаях - II стадия, в 7 случаях - III стадия. В 26 биоптатах опухолевой ткани молочной железы были выявлены люминальный  А и люминальный В/HER2/neu-негативный РМЖ; в  6 случаях был рак с тройным негативным фенотипом; в 1 биоптате был диагностирован люминальный/HER2/neu-позитивный рак и в 2 случаях - HER2/neu-позитивная карцинома. Ввиду малого числа наблюдений в двух последних подтипах в анализ включены пациенты с люминальным А и люминальный В/HER2/neu-негативным подтипами РМЖ. Для хранения и транспортировки операционного материала использовался раствор для стабилизации РНК RNA later, позволяющий выделять РНК из тканей и клеток без замораживания в жидком азоте. Выделение суммарного пула РНК проводили с помощью набора «Реал Бест экстракция 100» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск) в соответствии с инструкцией производителя. Обратная транскрипция была проведена при помощи специфичных праймеров к миРНК: миРНК-21, миРНК-221, миРНК-222, миРНК-155, миРНК-205, миРНК-20a, миРНК-125b, миРНК-146b, миРНК-200a. Реакцию обратной транскрипции проводили с использованием готовой реакционной смеси «Реал Бест Мастер микс ОТ» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск). Полученную кДНК, в объеме 3 мкл сразу использовали в качестве матрицы для проведения ПЦР. Измерение уровней экспрессии миРНК проводили методом ПЦР в реальном времени на амплификаторе CFX96 (Bio-Rad Laboratories, США) [2]. В качестве референсного гена использовали малую РНК U6. Реакцию ПЦР проводили в объеме 30 мкл с использованием готовой реакционной смеси «Реал Бест Мастер микс» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск) и раствора прямого и обратного праймеров (5 мкМ) и зонда (2.5 мкМ). Уровень экспрессии миРНК измерен при помощи метода ОТ - ПЦР в реальном времени. Статистическая обработка проводилась с применением  непараметрического U-критерия Манна - Уитни в программе Statistica 10.0. Для того чтобы  оценить значимость выявленных различий, проведена математическая  обработка методом построения ROC - кривой с использованием программного обеспечения IBM SPSS Statistics 21.

Результаты и обсуждение. Все миРНК разделены на онкогены и онкосупрессоры в зависимости от их роли в канцерогенезе РМЖ. МиРНК является онкогенной, если ее мишенью является онкосупрессорный ген, и наоборот, миРНК является онкосупрессорной, если её мишенью является онкоген. Стоит отметить, что одна миРНК может выступать как в роли онкогена, так и в роли онкосупрессора в зависимости от гена мишени, а также ткани, в которой она экспрессируется [1]. Проведен анализ экспрессии девяти миРНК: миРНК-21, -221, -222, -155, -205, -20a, -125b, -146b,  -200a в опухолевой ткани люминального А и люминального В/HER2/neu-негативного подтипов РМЖ в сравнении с прилежащей морфологически неизменной тканью. Были получены статистически значимые различия уровня экспрессии для семи  миРНК:  миРНК-21,-221,-222,-155,-205,-125b,-200a. Наиболее значимые различия в опухолевой ткани и в прилежащей морфологически неизмененной ткани (более  чем в 3 раза)  наблюдали  для двух онкогенных миРНК: миРНК - 155 и миРНК - 21 и двух онкосупрессорных миРНК: миРНК-205 и миРНК-125b (Табл.1). В ряде исследований было показано, что миРНК-21 является онкогеном и  ингибирует  опухолевые супрессоры  Pdcd4 и PTEN [9], а также коррелирует со стадией злокачественного процесса [3]. Одновременно было показано, что миРНК-155 также является онкогеном и участвует во множестве клеточных процессов, таких как регуляция пролиферации, миграция, вторжение, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП) и иммунный ответ [11,7]. Wang и соавт. показали, что в культуре клеток  РМЖ избыточная экспрессия миРНК-205 ингибирует пролиферацию, усиливает апоптоз, и уменьшается вторжение раковых клеток молочной железы, характеризуя миРНК-205 как онкосупрессор [13]. МиРНК-125b также является онкосупрессором для РМЖ и уменьшает пролиферативную активность  клеток [4,14]. Таким образом, миРНК-205 и миРНК-125b играют ключевую роль в прогрессировании и развитии рака молочной железы.  Так же стоит обратить внимание на  увеличение уровня экспрессии миРНК-200а почти в 2 раза в опухолевых образцах по сравнению с прилежащей морфологически неизмененной тканью (Табл.1). Семейство миРНК-200 регулирует ЭМП в различных типах рака, а также  коррелирует с наличием легочных метастазов [12,6].

Таблица 1

Изменение уровня экспрессии миРНК в опухолевой ткани люминального А и люминального В/HER2/neu-негативного подтипов РМЖ по сравнению с прилежащей морфологически неизмененной тканью

 

миРНК

155

21

200а

146b

205

125b

221

222

20a

Различие

3.68

3.66

1.78

1.02

7.84

7.78

1.71

1.56

1.17

Динамика

увеличение

понижение

P

0.000096

0.000980

0.082627

0.744125

0.000050

0.000020

0.006062

0.016630

0.212682

Примечания:  p<0.05 - различия статистически значимы между опухолевой тканью и прилежащей морфологически неизмененной тканью.

Проведен анализ экспрессии девяти миРНК: миРНК-21, -221, -222, -155, -205, -20a, -125b, -146b,  -200a в опухолевой ткани у пациенток с тройным негативным фенотипом РМЖ (ТНРМЖ) в сравнении с прилежащей морфологически неизменнной тканью. Были получены статистически значимые различия уровня экспрессии для трёх миРНК: миРНК-20a,-205,-125b (Табл.2). Во множестве исследований было показано, что миРНК-20a является онкогеном и сверхэкспрессируется при РМЖ [5]. Также  мы наблюдали значительное снижение (более чем в 3 раза) уровня экспрессии двух онкосупрессорных миРНК: миРНК-125b и миРНК-205 в опухолевой ткани в сравнении с  прилежащей морфологически неизмененной тканью. Как было описано выше миРНК-205 и миРНК-125b являются ключевыми участниками  канцерогенеза, и их пониженная экспрессия ассоциирована с неблагоприятным прогнозом РМЖ. Кроме того, мы наблюдали тенденцию к увеличению уровня экспрессии онкогенных миРНК -21 и миРНК-155 в опухолевой ткани тройного негативного РМЖ в сравнении с прилежащей морфологически неизменной тканью.

Таблица 2

Изменение уровня экспрессии миРНК в опухолевой ткани ТНРМЖ по сравнению с прилежащей морфологически неизмененной тканью

 

миРНК

155

21

20а

200a

146b

125b

205

222

221

Различие

7.01

3.23

3.16

2.52

1.97

10.45

3.50

1.86

1.12

Динамика

увеличение

понижение

P

0.111111

0.055555

0.031746

0.095238

0.547619

0.015873

0.007936

0.547619

0.841269

Примечания:  p<0.05 - различия статистически значимы между опухолевой тканью и прилежащей морфологически неизмененной тканью.

Проведено сравнение значений 2-∆∆Ct выбранной группы миРНК между пациентами с люминальными подтипами РМЖ и пациентами с ТНРМЖ (Табл. 3).

Таблица 3

Изменение экспрессии миРНК в ТНРМЖ по сравнению с люминальными подтипами РМЖ.

миРНК

Различие

Динамика

P

миРНК  - 221

43.03

увеличение

0.0377779

миРНК  - 222

11.3

увеличение

0.2246853

миРНК  - 20a

6.42

увеличение

0.0001413

миРНК  - 200a

2.39

увеличение

0.0965447

миРНК  - 155

2.33

увеличение

0.3078420

миРНК  - 21

1.99

увеличение

0.3813739

миРНК  - 146b

1.63

увеличение

0.1185532

миРНК  - 125b

1.89

понижение

0.2641339

миРНК  - 205

1.01

понижение

0.8265458

Примечания:  p<0.05 - различия статистически значимы между опухолевой тканью и прилежащей морфологически неизмененной тканью

Мы установили, что уровень экспрессии онкогенной миРНК-221 в 43 раза выше в ТНРМЖ, чем в люминальном А и люминальном В/HER2/neu-негативном подтипах РМЖ (p<0.05). МиРНК-221 является онкогеном и  регулирует два ключевых механизма в развитии опухоли: ингибирует супрессор p27 и способствует переходу ЭМП путем ингибирования E-кадгерина. По всей вероятности, миРНК-221 играет важную роль в ТНРМЖ [10]. Мы также установили, что уровень онкогенной миРНК-20a повышен почти в 7 раз в ТНРМЖ в сравнении с люминальными подтипами РМЖ (p<0.001). Таким образом, повышенная экспрессия онкогенных миРНК-221 и миРНК-20a является отличительной характеристикой ТНРМЖ и характеризует более агрессивное его течение. ROC-анализ позволил установить, что значение AUC для миРНК-221равно 0.772, что говорит о высокой значимости данного критерия в понимании различий между тройным негативным и люминальными подтипами РМЖ. Значение AUC для миРНК-20a равно 0.949, что делает его отличным маркером ТНРМЖ.

Заключение

Таким образом, полученные результаты позволили сформировать уникальный  профиль экспрессии миРНК для различных молекулярно-генетических подтипов РМЖ. Уровни экспрессии онкогенных миРНК-221 и миРНК-20a повышены в ТНРМЖ в сравнении с люминальным А и люминальным В/HER2/neu-негативным подтипами РМЖ, подтверждая характеристику ТНРМЖ, как наиболее агрессивного подтипа РМЖ. Для оценки значимости полученных различий проведен ROC анализ. Для миРНК-20a значение AUC равно 0.949. Таким образом, миРНК-20a является маркером ТНРМЖ в сравнении с люминальными подтипами РМЖ.

Рецензенты:

Антонеева И.И., д.м.н., заведующая гинекологическим отделением ГУЗ Областной клинический онкологический диспансер, врач высшей квалификационной категории, г. Ульяновск;

Демаков С.А., д.б.н., заведующий лабораторией хромосомной инженерией ИМКБ СО РАН, г. Новосибирск.


Библиографическая ссылка

Титов С.Е., Родионов В.В., Веряскина Ю.А., Титов С.Е., Родионов В.В., Генинг Т.П., Абакумова Т.В., Кометова В.В., Торосян М.Х., Жимулев И.Ф., Колесников Н.Н. ЭКСПРЕССИЯ МИКРОРНК В МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПОДТИПАХ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ // Современные проблемы науки и образования. 2015. № 5. ;
URL: https://science-education.ru/en/article/view?id=21656 (дата обращения: 02.06.2026).