Цель настоящей работы – сравнительный молекулярно-генетический анализ pmp-генов штамма хламидий ПП-87, на основе полученных массивов данных полногеномного секвенирования. Оценена идентичность/гетерогенность штамма Chlamydia sp. ПП-87 к штаммам Chlamydia psittaci GR9, Chlamydia psittaci 6BC и Chlamydia abortus S26/3 в процентном выражении выборок локусов pmp-генов. Проанализированные в данной работе pmp-гены, кодирующие полиморфные белки наружной мембраны штамма Chlamydia sp. ПП-87, имеют наряду с референсным штаммом GR9 по подавляющему большинству представленных генов близкородственное сходство к типовому штамму 6BC, нежели чем к штамму S26/3, за исключением pmp18D-гена последнего, являющегося одним из ключей к раскрытию молекулярных механизмов развития инфекционного процесса с обоснованием патогенеза хламидийной инфекции, ассоциированной с колонизацией плаценты хозяина внутриклеточным паразитом, и прояснению эволюции хламидий.
The purpose of this work - a comparative molecular genetic analysis of pmp-gene of chlamydial strain PP-87 on the basis of the whole genome sequencing data sets. The identity/heterogeneity of Chlamydia sp. strain PP-87 to strains of Chlamydia psittaci GR9, Chlamydia psittaci 6BC and Chlamydia abortus S26/3 in percentage value of pmp-genes loci samples was evaluated. Analyzed in this work the pmp-genes, encoding polymorphic outer membrane proteins of the Chlamydia sp strain PP-87 have along with the reference strain GR9 for the vast majority represented genes closely related similarity to the type strain 6BC, rather than to the strain S26/3, except pmp18D-gene of the last-named, which is one of the keys to the disclosure of molecular mechanisms of development of infection process with the justification of the pathogenesis of chlamydial infections associated with the placental colonization of the host by intracellular parasite, and to clarify the evolution of chlamydia.
1. Плахова, К.И. Генетические варианты C. trachomatis и поиск факторов вирулентности / К.И. Плахова, О.С. Кожушная, М.Р. Рахматулина, Н.В. Фриго // Вестник дерматологии и венерологии. – 2012. – № 3. – С. 48-54.
2. Равилов, Р.Х. Штамм хламидий Chlamydia psittaci, используемый для изготовления биопрепаратов для диагностики и профилактики хламидиоза песцов: авторское свидетельство № 1667869 / Р.Х. Равилов, Р.А. Шафикова, А.З. Равилов, А.Ю. Беклешова // опубл. 07.08.1991.
3. Рубаник, Л.В. Механизмы противохламидийного иммунитета и конструирование противохламидийной вакцины / Л.В. Рубаник // Медицинские новости. – 2006. – № 11. – С. 29-35.
4. Knittler, MR. Chlamydia psittaci: new insights into genomic diversity, clinical pathology, host-pathogen interaction and anti-bacterial immunity / M.R. Knittler, A. Berndt, S. Böcker, P. Dutow, F. Hänel, D. Heuer et al. // Int. J. Med. Microbiol. – 2014. – V. 304. – N. 7. – P. 877-893.
5. Thomson, N.R. The Chlamydophila abortus genome sequence reveals an array of variable proteins that contribute to interspecies variation / N.R. Thomson, C. Yeats, K. Bell, M.T. Holden, S.D. Bentley, M. Livingstone et al. // Genome Res. – 2005. – V. 15. – N. 5. – P. 629-640.
6. Vafin, R.R. On the nomenclature and classification of chlamydiae / Vafin, R.Kh. Ravilov, Kh.Z. Gaffarov, A.Z. Ravilov, G.M. Iskhakov, I.Kh. Bakirov, V.N. Kashov // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. – 2007. – V. 22. – N. 4. – P. 155-164.
7. Voigt, A. The Chlamydia psittaci genome: a comparative of intracellular pathogens / A. Voigt, G. Schöfl, H.P. Saluz // PLoS ONE. – 2012. – V.7. – N.4. – e35097. Available at: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0035097.
8. Wheelhouse, N.M. Processing of Chlamydia abortus polymorphic membrane protein 18D during the chlamydial development cycle / N.M. Wheelhouse, M. Sait, K. Aitchison, M. Livingstone, F. Wright, K. McLean et al. // PLoS ONE. – 2012. – V.7. – N.11. – e49190. Available at: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0049190.